1994年，斯嘉丽出演了她第一部影片《北》。她在片中扮演了一个小角色，随后又演了两部名气不大的影片《合适的理由》和《如果露西倒掉》。
1996年，斯嘉丽在影片《曼尼和罗》中扮演了一个失去双亲的小女孩，获得了当年的“独立精神奖”最佳女演员提名。1997年，不满13岁的约翰逊在《曼妮姐妹》（Manny Lo）中扮演了一个失去双亲的小女孩，她的表演大获好评，并获得美国独立精神奖最佳女主角提名。1998年，她得到大导演罗伯特-雷德福的青睐，请她在其新片《马语者》中扮演女主角克丽思汀-司科特-托马斯的女儿——一个失去一条腿的女孩。尽管这部影片毁誉参半，斯嘉丽的表演却受到广泛的赞誉，获得“票房炸弹奖”最佳女配角提名和多项“希望之星”头衔。
2000年，斯嘉丽接连出演了《幽灵世界》、《美国狂想曲》等影片，大多是独立制片的作品。
2001年被柯恩兄弟选中出演《缺席的人》的“琴声少女”贝蒂。
2002年，她出演了一步科幻恐怖片《八脚怪》。年，她主演了女导演索非亚·科波拉的影片《迷失东京》，并获得广泛好评。2004年，她又主演了《戴珍珠耳环的女孩》。这两部影片让她同时入围金球奖的剧情片和喜剧片最佳女主角。
2007年，斯嘉丽主演的《保姆日记》上映。在影片中，斯嘉丽饰演一个在纽约念儿童教育的大学生，为曼哈顿一家有钱人家当4岁男孩保姆的故事。
