自慰本身并没有什么危害，科学的认识己经取得一致。但若自慰过度或以自慰为嗜好则就是另外一种情况了。无论从心理上还是生理上都会产生一些不良影响。
心理上。在初期自慰后，伴有生理性的快感，往往会发生惊慌、恐惧、不知所措的情绪。好奇心驱使到处寻找有关书籍，一旦发现这种行为不好时，即会产生后悔、羞愧、担心、忧郁等心理，产生对自慰的自责犯罪感和恐惧感，这些心理成了沉重的精神负担。此后，会经常处于追求快感的动机与由此产生的自责的矛盾中。同时，强烈持久的性心理冲动又必然引起头昏、失眠、食欲不振、注意力不集中、记忆力减退等现象。除此之外，还可能产生抑郁症、强迫症、精神异常等，严重时会损害心理健康。
生理上。女性尿道约4厘米长，而且又接近阴道，自慰可以引起尿道口充血及轻微的损伤，病原体能够通过短而直的尿道，上行感染至膀胱，甚至肾脏，造成感染。轻者可有尿频、尿痛等不适，严重时可致腰痛、发冷、发烧。女性阴道也只有7厘米-8厘米长，正常情况下阴道口是闭合的，能起到一定的保护作用。自慰可使阴道口张开，若借助物具极易损伤组织器官，或者将病菌带入器官内，而出现相应的感染;或者不慎将物具掉入阴道、膀胱内。
此外，由于女性的性唤起比较困难，自慰时很容易捅破处女膜。再者，性冲动时白带增多，同时阴道口的前庭也会增加分泌液体，这些物质是供给细菌生长发育的良好条件。
正常情况下，女性阴道内是酸性环境，对防止细菌繁殖起到一定作用。但是，当月经期和月经来潮前后，这种环境有所改变，又为病原体的生长创造了条件，如果在这一阶段自慰很容易造成感染。既使没有直接造成炎症，在性兴奋的情况下，生殖器官是处于充血状态的，经常处于充血状态时，会使月经过多，造成生殖器官发炎。
